Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
HERPUD1Q15011 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERPUD1Q15011 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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