Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MDC1Q14676 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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