Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL9A2Q14055 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL9A2Q14055 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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