Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C1DQ13901 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1DQ13901 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1DQ13901 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1DQ13901 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1DQ13901 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1DQ13901 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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