Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1SQ13698 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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