Protein–RNA interactions for Protein: Q13530

SERINC3, Serine incorporator 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC3Q13530 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC3Q13530 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC3Q13530 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC3Q13530 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SERINC3Q13530 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC3Q13530 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms