Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PICALMQ13492 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PICALMQ13492 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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