Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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FOXE3Q13461 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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FOXE3Q13461 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXE3Q13461 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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