Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IKZF1Q13422 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IKZF1Q13422 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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