Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP140Q13342 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP140Q13342 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP140Q13342 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP140Q13342 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP140Q13342 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SP140Q13342 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP140Q13342 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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