Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTA1Q13330 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTA1Q13330 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTA1Q13330 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
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