Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGCGQ13326 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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