Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKP2Q13309 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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SKP2Q13309 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SKP2Q13309 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SKP2Q13309 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SKP2Q13309 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SKP2Q13309 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SKP2Q13309 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SKP2Q13309 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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