Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF6Q13247 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms