Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3BQ13214 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3BQ13214 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3BQ13214 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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