Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIK3Q13003 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIK3Q13003 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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