Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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FOXC1Q12948 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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FOXC1Q12948 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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FOXC1Q12948 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FOXC1Q12948 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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