Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN13Q12923 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN13Q12923 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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