Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH2Q12809 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNH2Q12809 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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