Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPQ12770 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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