Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 PDR10YOR328W 4695 nt5.88□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 WIP1YDR374W-A 270 nt5.88□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 VEL1YGL258W 621 nt5.88□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 YIL141WYIL141W 390 nt5.88□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 YLR458WYLR458W 381 nt5.88□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.88□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 INO4YOL108C 456 nt5.88□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 snR13snR13 124 nt5.88□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 MNT2YGL257C 1677 nt5.88□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 CBP2YHL038C 1893 nt5.88□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 YGL149WYGL149W 306 nt5.87□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 YIL012WYIL012W 342 nt5.87□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 YAE1YJR067C 426 nt5.87□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 SIP18YMR175W 240 nt5.87□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 HHF2YNL030W 312 nt5.87□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 FUS1YCL027W 1539 nt5.86□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 RPL8BYLL045C 771 nt5.86□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.86□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 IRC23YOR044W 474 nt5.86□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 DAD3YBR233W-A 285 nt5.86□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 GDE1YPL110C 3672 nt5.85□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 FAP1YNL023C 2898 nt5.85□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 HIS4YCL030C 2400 nt5.84□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 GPI10YGL142C 1851 nt5.84□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 VHC1YBR235W 3363 nt5.84□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt5.84□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.84□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 PHO87YCR037C 2772 nt5.84□□□□□ -1.47
NOP53Q12080 THI7YLR237W 1797 nt5.83□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 PSP1YDR505C 2526 nt5.83□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YDL228CYDL228C 642 nt5.83□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YDR344CYDR344C 444 nt5.83□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt5.83□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YLR230WYLR230W 306 nt5.83□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YAR068WYAR068W 486 nt5.83□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 HPC2YBR215W 1878 nt5.83□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 STN1YDR082W 1485 nt5.83□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YGR266WYGR266W 2106 nt5.83□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YOL019WYOL019W 1656 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 TPS3YMR261C 3165 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 RIM13YMR154C 2184 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 HOT1YMR172W 2160 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 RIM15YFL033C 5313 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 SNA4YDL123W 423 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 NOP6YDL213C 678 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YGL042CYGL042C 306 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 PET191YJR034W 327 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YPL039WYPL039W 951 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 snR35snR35 204 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 BCH2YKR027W 2298 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 MCD1YDL003W 1701 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YNL193WYNL193W 1677 nt5.82□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YDL199CYDL199C 2064 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YMR102CYMR102C 2505 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 HUL5YGL141W 2733 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YFR054CYFR054C 579 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YGL088WYGL088W 366 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YKU70YMR284W 1809 nt5.81□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 VPS52YDR484W 1926 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 SGN1YIR001C 753 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 CWC24YLR323C 780 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 ILV5YLR355C 1188 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 HUB1YNR032C-A 222 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 OPY2YPR075C 1083 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 PIS1YPR113W 663 nt5.8□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 HCS1YKL017C 2052 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YJL016WYJL016W 1686 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 GMC1YDR506C 1827 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YCK2YNL154C 1641 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YFR056CYFR056C 369 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 MVB12YGR206W 306 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt5.79□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 IRC4YDR540C 540 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 YER076W-AYER076W-A 348 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 RPL6BYLR448W 531 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 SAP30YMR263W 606 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 HIR2YOR038C 2628 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 VPS9YML097C 1356 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 BNA4YBL098W 1383 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 SRC1YML034W 2505 nt5.78□□□□□ -1.48
NOP53Q12080 ICR1ICR1 3199 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 RPS7BYNL096C 573 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 YBL073WYBL073W 312 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 YPL238CYPL238C 390 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 DNF2YDR093W 4839 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 UTP25YIL091C 2166 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 HXT14YNL318C 1623 nt5.77□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 MDR1YGR100W 2853 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 ATP17YDR377W 306 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 TIF35YDR429C 825 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 TMA10YLR327C 261 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 EAP1YKL204W 1899 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 YDL180WYDL180W 1644 nt5.76□□□□□ -1.49
NOP53Q12080 VPS73YGL104C 1461 nt5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms