Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSRP1Q08945 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms