Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE4DQ08499 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4DQ08499 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms