Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ACTN3Q08043 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN3Q08043 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms