Protein–RNA interactions for Protein: Q07820

MCL1, Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCL1Q07820 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCL1Q07820 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCL1Q07820 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms