Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABPAQ06546 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPAQ06546 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms