Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KDSRQ06136 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDSRQ06136 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms