Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN11Q06124 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms