Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 STD1YOR047C 1335 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 YCL020WYCL020W 1317 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 KHA1YJL094C 2622 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 RSM28YDR494W 1086 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 EMI1YDR512C 564 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 HLR1YDR528W 1272 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 NSA2YER126C 786 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 YFR054CYFR054C 579 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 MST27YGL051W 705 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 SDS22YKL193C 1017 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 COX14YML129C 213 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 ATG3YNR007C 933 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 SRL4YPL033C 846 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 MBA1YBR185C 837 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 AIM4YBR194W 372 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 YHR078WYHR078W 1659 nt2.53□□□□□ -2
YHC1Q05900 CYR1YJL005W 6081 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 BNR1YIL159W 4128 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 RSM24YDR175C 960 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SAE2YGL175C 1038 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 RPL16BYNL069C 597 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 MSN1YOL116W 1149 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YOR152CYOR152C 771 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YPL142CYPL142C 318 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YPR203WYPR203W 309 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SUS1YBR111W-A 291 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SOK1YDR006C 2706 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ORC1YML065W 2745 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 BRE5YNR051C 1548 nt2.52□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 LST4YKL176C 2487 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SLF1YDR515W 1344 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 REF2YDR195W 1602 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 RIX1YHR197W 2292 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YDR209CYDR209C 414 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 KEI1YDR367W 666 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 VEL1YGL258W 621 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YJL147CYJL147C 1149 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ENV10YLR065C 546 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 COA4YLR218C 453 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ARC18YLR370C 537 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ADF1YCL058W-A 342 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 BCK1YJL095W 4437 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 CDC55YGL190C 1581 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SRO77YBL106C 3033 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ADY4YLR227C 1482 nt2.51□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 NOP12YOL041C 1380 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YDR262WYDR262W 819 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 RMT2YDR465C 1239 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 PDS5YMR076C 3834 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ATX1YNL259C 222 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YOR277CYOR277C 309 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 EXO84YBR102C 2262 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 URB2YJR041C 3525 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YCL019WYCL019W 5313 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 TOM70YNL121C 1854 nt2.5□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SRB4YER022W 2064 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 HAA1YPR008W 2085 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YKL075CYKL075C 1353 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YJL132WYJL132W 2253 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 CIK1YMR198W 1785 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 DIA2YOR080W 2199 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 AI2Q0055 2565 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SKO1YNL167C 1944 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 DBP10YDL031W 2988 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 UBC5YDR059C 447 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YIP1YGR172C 747 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 AIM18YHR198C 966 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YKL066WYKL066W 444 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SRL3YKR091W 741 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 MST28YAR033W 705 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 ADI1YMR009W 540 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YNR025CYNR025C 360 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YRO2YBR054W 1035 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 AFT2YPL202C 1251 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 CUR1YPR158W 759 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SWD3YBR175W 948 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 STN1YDR082W 1485 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 MET5YJR137C 4329 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 KEL2YGR238C 2649 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 RTT10YPL183C 3042 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 JJJ2YJL162C 1752 nt2.49□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 DUF1YOL087C 3351 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 SEC26YDR238C 2922 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 NTF2YER009W 378 nt2.48□□□□□ -2.01
YHC1Q05900 YGL159WYGL159W 1113 nt2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22 ms