Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALD1Q05682 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALD1Q05682 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CALD1Q05682 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms