Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN1Q04323 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN1Q04323 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms