Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RELAQ04206 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RELAQ04206 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RELAQ04206 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RELAQ04206 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RELAQ04206 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RELAQ04206 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RELAQ04206 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELAQ04206 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELAQ04206 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELAQ04206 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELAQ04206 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELAQ04206 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELAQ04206 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RELAQ04206 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms