Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
ERCC6Q03468 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ERCC6Q03468 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms