Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NHLH2Q02577 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms