Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSG1Q02413 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSG1Q02413 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms