Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POU5F1Q01860 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POU5F1Q01860 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms