Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDR2Q01850 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms