Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1DQ01668 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms