Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DEFA6Q01524 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DEFA6Q01524 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms