Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DEFA5Q01523 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DEFA5Q01523 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms