Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
E2F1Q01094 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms