Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF9Q00978 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRF9Q00978 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms