Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSF1Q00613 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSF1Q00613 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms