Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMAD3P84022 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMAD3P84022 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms