Protein–RNA interactions for Protein: P82251

SLC7A9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A9P82251 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC7A9P82251 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A9P82251 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms