Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN10P78369 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN10P78369 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms