Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPC5P78333 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC5P78333 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms