Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPM4P67936 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPM4P67936 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPM4P67936 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPM4P67936 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPM4P67936 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM4P67936 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM4P67936 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms