Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTG1P63261 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms