Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL23P62829 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL23P62829 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL23P62829 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL23P62829 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL23P62829 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL23P62829 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL23P62829 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL23P62829 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL23P62829 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL23P62829 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL23P62829 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPL23P62829 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL23P62829 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL23P62829 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPL23P62829 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL23P62829 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL23P62829 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL23P62829 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms